甲基化檢測BSP
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甲基化檢測BSP服務介紹:亞硫酸氫鹽處理后測序(bisulfite sequencing PCR,BSP)法是檢測基因甲基化的經(jīng)典方法,其原理為:用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA,所有未發(fā)生甲基化的胞嘧啶(C)被轉(zhuǎn)化為尿嘧啶(U),而甲基化的胞嘧啶則不變。隨后設計BSP引物進行PCR,在擴增過程中尿嘧啶全部轉(zhuǎn)化為胸腺嘧啶。
甲基化檢測BSP
服務介紹:
亞硫酸氫鹽處理后測序(bisulfite sequencing PCR,BSP)法是檢測基因甲基化的經(jīng)典方法,其原理為:用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA,所有未發(fā)生甲基化的胞嘧啶(C)被轉(zhuǎn)化為尿-嘧啶(U),而甲基化的胞嘧啶則不變。隨后設計BSP引物進行PCR,在擴增過程中尿-嘧啶全部轉(zhuǎn)化為胸腺嘧啶。最后,將PCR產(chǎn)物克隆至載體后進行測序,測序結(jié)果與未經(jīng)處理的序列比較,分析CpG位點是否發(fā)生甲基化,這種方法稱為BSP-克隆測序法。此方法精確度高,能明確目的片段中每一個CpG位點的甲基化狀態(tài)。一般選取10個克隆子的測序結(jié)果進行數(shù)據(jù)分析。
名稱 | 規(guī)格 |
甲基化檢測BSP | /基因/樣 |
實驗流程:
取材-提取基因組DNA-亞硫酸氫鹽處理-純化DNA-BSP引物合成-PCR擴增-TA克隆-測序-發(fā)報告
送樣運輸要求:
動物組織:新鮮的組織量100 mg(黃豆大小),最少50 mg(綠豆大小),脂肪組織、結(jié)締組織、纖維化組織適當增加。干冰運輸。
植物組織:新鮮的葉、果肉、種子等最少需100 mg。干冰運輸。
細胞:1×10^6個細胞,收集細胞沉淀,干冰運輸。
全血:最少1 mL新鮮血液EDTA抗凝管,-20度運輸。
DNA:體積≥50 uL,濃度≥ 50 ng/uL,干冰運輸。
注:植物樣本的甲基化實驗需要客戶提供具體的啟動子序列信息。